部分关卡因其特殊机制或高难度设计需要玩家格外注意。演武场中的蜀国篇考验玩家对武将搭配和站位的理解，敌方阵容由蜀国精英组成，推荐使用黄月英、黄舞蝶、孟获、兀突骨和刘备的组合，并将盾兵置于前排，输出武将放在后方，通过合理布阵可轻松通关。
长坂坡战役是游戏中的高难度关卡之一，玩家需根据敌方兵种特点调整阵容，例如利用盾兵抵挡弓兵攻击，再配合刺客兵反击。地形因素在该关卡中尤为重要，山丘和河流等可提供战术优势，例如将弓兵部署在高处以增加攻击距离。武将培养和资源管理也是通关的关键，需优先提升主力武将等级并合理分配装备。
第三船队第5关对低战力玩家挑战较大，需通过精细的站位和武将选择弥补战力差距。推荐阵容包括孟获、马云禄、马腾、甘宁等武将，并注意13-16号位不站人以避免敌方兀突骨干扰。该关卡强调阵容的协同性，例如借力高星级武将如马超可显著降低通关难度。
赛季兵典的六个关卡各有特点，例如强盾篇需优先击杀敌方董卓以阻止其回血，幻像篇需应对关羽的幻象攻击，而神机篇则依赖军师黄月英的拒马和箭塔阻挡敌人。玩家需根据关卡提示调整战术，例如在五虎篇中利用张飞快速击破前排，赵云和黄忠针对后排输出。
黄巾之战240关是后期高难度挑战，敌方轻骑和重骑需分别用盾将和回血型武将应对。该关卡要求玩家精准对位并利用输出武将协助破敌，同时需关注挂机收益机制，通关后可通过快速挂机高效获取奖励。
布阵篇和励军篇作为教学关卡，虽难度较低但暗藏策略要点。布阵篇需利用张辽的列队强化技能集中输出，而励军篇则需选择步练师等单体爆发武将克制袁术的回血机制。这两关的核心在于理解兵种克制和技能联动。
九州争霸玩法采用三局两胜制，需合理分配三组阵容的强度，避免田忌赛马策略导致意外失利。平民玩家建议均衡培养多支队伍，并利用晋级后的布阵时间调整战术。竞猜功能也为未参赛玩家提供了额外奖励途径。
关注关卡机制、兵种克制和资源分配是攻克少年三国志零难点的基础。演武场、赛季兵典等玩法需灵活运用系统提示，而高难关卡则依赖深度培养和阵容试错。
